Før du velger overnatting i Karpathos, bør du undersøke hvilket av de mange ulike områdene du vil bo i. Øyas hovedstad er Pigadia, og her finner du et hav av koselige kafeer og restauranter ved vannkanten, i tillegg til flotte antikke ruiner og kirker. I Pigadia finnes det flere budsjetthoteller og andre rimelige overnattingsmuligheter, noe som gjør byen populær blant backpackere. Dersom du reiser med familien, bør du vurdere å bo i den koselige, lille landsbyen Kyra Panagia, som er hjem til en av de mest kjente og elskede strendene på Karpathos. Denne landsbyen er velorganisert og stranden er rolig og trygg, noe som gjør den ideell for de som reiser med barn. Du finner også flere lokale tavernaer i nærheten av stranden. For par som reiser på tur og ønsker en romantisk ferie, er det flere idylliske steder å velge mellom. Bo i den tradisjonelle landsbyen Olympos som ligger på toppen av en åsside og omringet av store fjell, eller velg den lille fiskerlandsbyen Diafani dersom du ønsker en rolig og avskjermet ferie i vakre omgivelser.